Nat med | Нэгдсэн хавдарыг зураглах олон Ommics-ийн хандлага

Nat med | Нэгдсэн хавдар, дархлаа, дархлаа, микробезаль, микробиональ хорт хавдрын ландшафтыг дарахад нь дархлааны системтэй микробионы харилцан үйлчлэлийг илтгэнэ
Хэдийгээр анхан шатны хорт хавдартай, сүүлийн жилүүдэд зориулж Biomarkarkers-ийг судалж үзсэн. Судлаачид генуляцид суурилсан дархлаажуулалтын холбоо, микробик генотик атлас (TCGA) Colectal Cohort болон өвчтөний амьд үлдэх холболтын холболтыг тэмдэглэжээ.

Судалгаан, хорт хавдрын хорт хавдрын хорт хавдрын хэмжээ, хорт хавдрын тоон шинж чанар, хорт хавдрын тоон шинж чанарууд нь эмнэлзүйн болон микроаль үр дүнг харгалзан үздэг бөгөөд энэ нь тэдний харилцан үйлчлэл нь өвчтөний үр дүнг эрс холбоотой байдаг.
Фенотипийн нарийн төвөгтэй байдал, үр дүнгийн болон транрагийн судалгааны ажилтнуудын хамт олон тооны амьтан, нэгдсэн оноог олж, нэгдсэн оноог боловсруулж, микроскорын бүлгүүдийг (ICR) -ийг цуглуулж, батлан ​​дуулгаж баталгаажуулсан Баг нь 348 өвчтөний цогцолборын иж бүрдэл, энгийн өнгөт эдийг агуулсан, энгийн өнгөний дээж,, энгийн өнгөний үзүүр, Судалгааг байгаль орчинд хэвлүүлсэн нь "нэгдсэн хавдар, микроби, микроби, микроби, микроби, микроби,
Байгаль анагатад хэвлэгдсэн нийтлэл

Байгаль анагатад хэвлэгдсэн нийтлэл

AC-ICAM-ийн тойм

Судлаачид шинэхэн хөлдөөсөн хавцлын дээжийг шинжлэхэд orthogonal геномик платформыг ашигладаг бөгөөд Бүхэл бүтэн эксомен дарааллаар суурилсан (WES), RNA-SEQ мэдээллийн чанар, indoce-ийн шалгуур үзүүлэлт, indopions-ийн шалгуур үзүүлэлт, introuse-ийн шалгуур үзүүлэлтийг давтаж, дунджаар 4.6 жил ажилласан. Судалгааны баг нь энэ нөөцийг нэрлэсэн Sidra-Lumc ACCAC ACCAM: Дархлаа импотт-микроби-микроби-той (зураг 1).

ICR ашиглан молекуляр ангилал

Дараахь зүйлсийн тогтмол бус депретик тэмдэглэгээг хүлээн авбал соёлын генетик тэмдэглэгээг (ICR) гэж нэрлэдэг. ICR нь Хөхний хорт хавдрыг багтаасан олон төрлийн хорт хавдрын төрөлд дархлаатай хариу үйлдэл үзүүлсэн.

Нэгдүгээрт, судлаачид ACR ICR-CONOR-ийн гарын үсэг, ACR ICR-COINT-ийн гарын үсэгийг гурван кластераар ангилахын тулд ICR ICR-ийн гарын үсэг, дунд зэргийн ICR (ХӨДӨЛМӨР). Судлаачид угсарсан молекулын молекулын дэд төрлийг (CMS) -тэй холбоотой дархлалтай холбоотой байдаг. CMS ангиллыг CMS1 / дархлааж, CMS2 / Cans2 / Cans2 / Cans3 / CMS3 / CMS3 / MESABOL, CMSECHYMAL. Шинжилгээ, дарангуйлалтай, илбэкприптив, илбэ-доман, зүлгүүрийн чиглэлээр icr-ийн оноо, эерэг холболтыг сөрөг байдлаар холбосон нь зөвхөн CMS4 хавдартай байсан.

Бүх CMS-д, байгалийн алуурчин (nk) leak болон t эсийн дэд хэсгүүд нь icrokocyte-ийн дэд хэсгүүдэд хамгийн өндөр хувьсагч (зураг 1d), icro inclune oftstice-ыг өнгөт хорт хавдраас дээшлүүлж, icro inc inc and (зураг 1d) -ээс өндөр, pfsses-ийг хамгийн өндөр түвшинд боловсруулдаг.

1-1

Зураг 1. AC-ICAM судалгааны загвар, дархлаатай холбоотой генийн гарын үсэг, дархлаа, дархлаа, молекулын дэд хэсэг.
ICR нь хавдрын хавдрыг баяжуулсан, Clonally-ийн олшруулсан т эсүүд
Зөвхөн T эсийн цөөнх нь цогцолборын цогцос нь хавдрын эсрэг шинж чанарыг илэрхийлсэн гэж мэдэгдсэн (10% -иас бага). Тиймээс, ихэнхдээ incra-incum T эсийг тэсвэрлэгч T эсүүд гэж нэрлэдэг. Үр дүнтэй Tcrs-ийн ердийн TOLLS-ийн тоонуудтай хамгийн хүчтэй хамаарал нь t эсийг тооцоолоход ашигладаг (Rna-seq) -ийг ажигласнаар (Rna-seq) ажиглагдсан. ICR CLUSTERS-д (нийт ба см-ийн ангилал) ICR-HERC-ийн хамгийн өндөр нь ICR-HERMS CMS-ийн CMS1 / CMS SEBSTY SMASTYPE-ийг ICR-HIND TUMS-ийн хамгийн өндөр түвшинд ажиглав. Бүхэл транскриптийг ашиглан (18,270 ген), Зургаан ICR ген (IFNG1, CXCL1, CXCL10) TCCLONE SEAM CLOWIEL-тэй харьцангуй арван генийн тоонд багтжээ. Дархлаа tcr clonate нь хавдрын хариу үйлдэлтэй CD8 + тэмдэглэгээг ашиглан ихэнх iCR генүүдтэй харьцуулбал илүү хүчтэй хамааралтай. Дүгнэлтэд Дээрх шинжилгээ нь icr гарын үсэг нь хавдрын гарын үсэг нь хавдрын нэр томъёо, Clonally Bume-ыг эзэлж, прогнозын урьдчилсан дүгнэлтийг олж харуулж байна.
2
Зураг 2. TCR хэмжигдэхүүн, дархлаатай холбоотой ген, дархлаа, молекулын дэд хэсгүүд.
Эрүүл, бүдүүн гэдэсний эдэд микробиомийн найрлага
Судлаачид 16-аас 246 өвчтөнд байгаа хавдрын болон эрүүл хулгайлсан хавдар, эрүүл бүдүүвчний эдийг ашиглан ДНХ-ийн rapne-ийг ашиглан ДНХ-д RRNA-г ашигласан (Зураг 3A). Баталгаажуулалтын хувьд Судлаачдад Нэмэлт 42 ro Gene Encum-ийн нэмэлт ДНХ-ээс Нэмэлт ДНХ-т тохирохгүй байна. Нэгдүгээрт, судлаачид харьцангуй цомог, эрүүл мэндийн болон эрүүл хулганы хоорондох харьцангуй элбэг дэлбэг харьцааг харьцуулав. Эрүүл дээжтэй харьцуулахад хавтгайрч төгссөн цомгийг нэмэгдүүлэв (Зураг 3A-3D) Альфа олон талт байдал (дээж, элбэг дэлбэг байдал, элбэг дэлбэг, элбэг дэлбэг байдал, элбэг дэлбэг байдал нь ICR-LIVE-аас бага,
Микробионик профиль, эмнэлзүйн үр дүнгийн хоорондох эмнэлзүйн хувьд холбогдох холбоог илрүүлэхэд хүргэсэн, судлаачид 16s RRNA GEROBIOME-ийг олж тогтооход чиглэсэн микробиярыг олж мэдэхэд чиглэгддэг. AC-ICAM246 дээр судлаачид ZS COX-ийн бус шинж чанаруудыг сонгосон OS COX регрессийн загвар (Дифференциональ эрсдэлтэй).
Энэхүү сургалтанд COHORT дээр (ICAM246), бага MBR оноо (MBR <0, бага MBR) нас барах эрсдэл багатай холбоотой (85%). Судлаачид бага MBR (Эрсдэл) ба бие даасан хүчинтэй кохорт (ICAM42 ба TCGA-Coad) хоорондын холбоог баталгаажуулав. (Зураг 3) Судалгаа нь эндогастрик коксик кокс, MBR-ийн хоорондох хүчтэй хамаарлыг илэрхийлсэн.
3 дайсан
Зураг 3. Микробиоми, эрүүл эд, эрүүл эдэд, ICR болон өвчтөний оршин тогтнохтой холбоотой.
Байгуулах
Энэхүү судалгаанд ашигласан олон омистын хандлага нь Colorectal Dancel-ийн Моликетийн хариуг нарийвчлан илрүүлж, молобоби, дархлаан ба дархлааны системийг харуулж байна. Хавдар, эрүүл эдэд гүнзгий, эрүүл эд эсийн үр дүн нь хавдар, icrumberic-ийн үр дүнтэй бөгөөд icrumber-айрыг олж авах нь хавдартай, магадгүй хавдар, магадгүй өвөрмөц шинж чанартай байж магадгүй юм.

16s Micro Microbiome-ийн найрлагыг шинжлэх замаар ACCAM SEMOMINES-ийг ACCAM SEMOUNCE-ийг ашиглаж байна. Хэдийгээр энэ гарын үсгийг хавдрын дээжээс гаргаж авсан, эрүүл өнгөт өнгөт, хавдрын Micromie-ийн хоорондох батлан ​​диатель нь өвчтөний гэдэсний найрлагыг олж авахыг санал болгож байна. ICR болон MBR-ийн оноог нэгтгэснээр, бүдүүн гэдэсний биомаркерыг таних, хүлээн зөвшөөрдөг олон Omome Biomarker-ийг олж тогтоох боломжтой байсан. Судалгааны олон Ommicate мэдээллийн сан нь хорт хавдрын биологийг илүү сайн ойлгохын тулд нөөцийг илүү сайн мэддэг бөгөөд хувийн эмчилгээний хандлагыг олж мэдэхэд тусалдаг.

Бүрдөх:
Roeldans, j., kuppen, pjk, pjk, ehmed, ei ei al. Хулгайлсан хавдар, дархлаа, микробиомотик атлас. Nat Med 29, 1273-12866 (2023).


Шуудангийн цаг: Jun-15-2023
Нууцлалын тохиргоо
Жигнэмэгийн зөвшөөрлийг удирдах
Хамгийн сайн туршлагыг хангахын тулд бид күүки, төхөөрөмжийн мэдээллийг хадгалах, эсвэл нэвтрэхэд ашигладаг технологийг ашигладаг. Эдгээр технологийг зөвшөөрөх нь энэ сайт дээрх зан авир, өвөрмөц үнэмлэх, өвөрмөц үнэмлэхийг боловсруулах зэрэг мэдээлэл боловсруулах боломжийг бидэнд олгоно. Зөвшөөрлийг зөвшөөрөх эсвэл татгалзах, татгалзах нь тодорхой шинж чанар, функцэд сөргөөр нөлөөлж болзошгүй юм.
✔ Хүлээн авсан
✔ Хүлээн авах
Татгалзах, хаах
X